Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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