Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd2Q9CZB3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms