Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930519P11RikQ9CUJ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms