Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms