Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Msantd4Q91YU3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msantd4Q91YU3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms