Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms