Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms