Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6bQ8K2H2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms