Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms