Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP07

Tmem220, Transmembrane protein 220, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem220Q8BP07 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem220Q8BP07 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms