Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik4Q8BMF5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms