Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Sys1Q78S06 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sys1Q78S06 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sys1Q78S06 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sys1Q78S06 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sys1Q78S06 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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