Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd4Q6ZPR5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd4Q6ZPR5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms