Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms