Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp12Q6P5B0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms