Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms