Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NinQ61043 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NinQ61043 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NinQ61043 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NinQ61043 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NinQ61043 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NinQ61043 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NinQ61043 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NinQ61043 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NinQ61043 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms