Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm3558Q5FWC9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3558Q5FWC9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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