Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bdp1Q571C7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms