Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051142Q3V0M8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms