Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms