Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col19a1Q0VF58 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms