Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms