Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms