Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs2Q03350 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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