Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms