Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms