Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Saa4P31532 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms