Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms