Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms