Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms