Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capns1O88456 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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