Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casq1O09165 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casq1O09165 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms