Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SmgcF6VRN1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SmgcF6VRN1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SmgcF6VRN1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms