Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptbn5F6UCX4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms