Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5930D3Z257 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms