Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39aA2ACP1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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