Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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