Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp3a41aQ9JMA7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp3a41aQ9JMA7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms