Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod4Q9JLH8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Tmod4Q9JLH8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmod4Q9JLH8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms