Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk3aQ9JKX8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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