Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms