Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpcn1Q9EQJ0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpcn1Q9EQJ0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tpcn1Q9EQJ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpcn1Q9EQJ0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tpcn1Q9EQJ0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpcn1Q9EQJ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tpcn1Q9EQJ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tpcn1Q9EQJ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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