Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms