Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg9Q9DB90 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms