Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms