Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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