Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms