Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms