Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms